口疮的病因既有外因，也有内因。内因责之于婴幼儿因血少气弱，黏膜柔嫩，不耐邪热熏灼或久病体虚而易于罹患本病。外因由于平素调护不当，感受风热之邪；或喂养不当，恣食膏粱厚味，过食辛辣刺激之物；或口腔不洁，秽毒内侵等原因所致。

盖心开窍于舌，心脉通于舌上；脾开窍于口，脾络通于口；肾脉循喉咙连舌本；胃经循颊络齿龈，故无论外感、内伤，凡化热、化火者均可循经上炎，熏蒸口舌而发病。诚如《诸病源候论唇口病诸候口舌疮候》所言：“手少阴心之经也，心气通于舌；足太阴脾之经也，脾气通于口。脏腑热盛，热乘心脾，气冲于口与舌，故令口舌生疮也”。

总之，本病病位在心脾胃肾。病性虽有虚实之分，但其发病机制皆为火热循经上炎，熏蒸口舌发为口疮。