根据鞭毛的数量和部位，可将鞭毛菌分成4类：①单毛菌；②双毛菌；③丛毛菌：菌体一端或两端有一丛鞭毛；④周毛菌：菌体周身遍布鞭毛。
鞭毛功能是：
①鉴定价值，鞭毛是细菌的运动器官，细菌能否运动可用于鉴定。
②致病作用：鞭毛运动能增强细菌对宿主的侵害，因运动往往有化学趋向性，可避开有害环境或向高浓度环境的方向移动。
③抗原性：鞭毛具有特殊H抗原，可用于血清学检查。
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