抗体是免疫系统用来鉴别和抑制外源物质（例如细菌和病毒）的一种蛋白质复合体。每种抗体只识别特定的目标抗原。

当巨噬细胞吞下一个病原菌后，它将自己的一部分蛋白质附着在第二类主要组织相容性复合体（MHC）蛋白上。这个复合体移动到细胞膜外表，被T淋巴细胞识别。T淋巴细胞将其与B淋巴细胞膜表面的类似结构比较。如果发现匹配的结构，T淋巴细胞激活B淋巴细胞，开始产生抗体。一个B淋巴细胞只能生成与自身细胞膜表面结构对应的抗体。

识别病毒的抗体可以仅凭病毒大小就能阻止病毒入侵细胞。

识别细菌的抗体可以标记细菌，使得巨噬细胞可以吞噬它们。抗体也可以与血清补体成分一起直接杀死细菌。