从粪便内检查虫卵或孵化毛蚴以及直肠粘膜活体组织检查虫卵。有：
1.直接涂片法：重感染地区病人粪便或急性血吸虫病人的粘液血便中常可检查到血吸虫虫卵，方法简便，但虫卵检出率低。
2.毛蚴孵化法：可以提高阳性检出率。
3.定量透明法：用作血吸虫虫卵计数。
4.直肠粘膜活体组织检查：慢性及晚期血吸虫病人肠壁组织增厚，虫卵排出受阻，故粪便中不易查获虫卵，可应用直肠镜检查。
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