1、互生：较松散联合，可以是一方得利，或双方有利。（混菌培养）

2、共生：紧密结合在一起，高度发展时，形成特殊共住体，生理上有分工，组织、形态上产生新结构。

地衣：藻类 真菌

3、寄生：一种生物生活在另一种生物表面或体内，从后者获得营养。

4、拮抗：一种生物产生不利于另一种生物生存的代谢物质或改变环境条件，抑制甚至杀死另一种生物的现象。

5、捕食：一种生物直接吞食另一种生物。

二、与高等植物关系

共生：根瘤菌，菌根菌

互生：根际微生物

寄生：植物病原微生物

三、与人及动物关系

共生：瘤胃微生物，白蚁

互生：人体肠道正常菌群

寄生：病原微生物，寄生于昆虫（生物杀虫剂）

择生生物（悉生生物）：接种有一种或多种已知微生物的无菌动物。