土壤是自然界最适宜微生物生长的环境，具有微生物所需一切营养物及各种条件。种类主要是异养型种类。

二、水中微生物

种类和数量要比土壤中少得多。

淡水中微生物主要来源于土壤、空气、污水或死亡腐败的动植物体。海水中微生物总量超过陆地。

饮用水标准：每ml水细菌总数不超过100个，E.coli每升水不超过3个。

三、空气中微生物

空气非微生物生长良好环境。微生物通过各种方式传入空气，又随风传播。

数量取决于环境。

潮湿空气中微生物比干燥空气中少，因为潮湿空气中微生物被小水滴带着沉降下去了。

空气中菌数测定：过滤收集，培养计数。

四、极端环境微生物

了解这些微生物，可以利用其特殊基因、机能，创造有用新种。